No, assolutamente devi togliere le tarta o il botia (c'è stato un caso, se non sbaglio è capitato a viper77, in cui i funghi dei pesci hanno attaccato le sterno)... Meglio se togli le tarta così non rischi che ci siano altri pesci con micosi che rischiano di attaccare loro la micosi. Trattandolo tenedoci insieme le tarta rischi inutilmente le 2 povere carinatus.
Tutto questo indipendentemente dalla cura che userai per il botia.
(so che non ho risposto esattamente alla tua domanda... per quello credo dipenda da cosa usi per curare il botia, ma se ascolti me li separi subito.
Per sicurezza se rimuovi le tarta mettile a bagno un po' in acqua con 2-3 gocce di blu di metilene, non di più, così ucciderai eventuali micosi che sono all'inizio... fallo anche per 2-3 giorni. Ma questa è solo una misura di sicurezza per le tarta). Se volessi spostare il botia fai lo stesso ma disinfetta bene anche l'acquario
Spero di esserti sato utile;-) e mi spiace che la risposta non è quella che avresti voluto;-)
PS
se non curi come si deve il botia morirà, i pesci non reggono le micosi come le tarta, in pochi gorni partono...